Real-time RT-PCR
Ejemplo de uso de la aplicación qPCR: Ct.
La herramienta desarrollada se a diseñado para el análisis de datos de sistemas Real-time
high throughput, concretamente para datos obtenidos del sistema:
7900HT Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems)Que no significa que no pueda ser compatible con otros sistemas
high throughput como LightCycler 480 (
Roche), Rotor-Gene (
QIAGEN), Opticon (
BIO-RAD).
Una vez la Real-time RT-PCR a finalizado todo el proceso llega el momento de obtener y analizar los datos de expresión.
A continuación se presentan de forma esquemática los pasos a seguir:
- Obtener los datos de fluorescencia de la Real-time RT-PCR
- Crear un fichero con las muestras y la clase a la que pertenece cada muestra
- Entrar a la Plataforma de Bioinformática y ir a Herramientas --> qPCR: Ct
- Importar el fichero de clases creado en el segundo punto
- Importar los datos de la Real-time RT-PCR obtenidos en el primer punto
- Dar un título al estudio
- Introducir los genes utilizados como housekepping o genes de referencia
- Indicar las diferentes clases con el indicador (ID) correspondiente
- Introducir el fichero de eficiencias
- Ejecutar la aplicación: analizar
