PLATAFORMA BIOINFORMÁTICA

Real-time RT-PCR

2.Crear un fichero con las muestras y la clase a la que pertenece cada muestra

La herramienta qPCR:Ct permite analizar el subconjunto de muestras que desees de entre todas las muestras presentes en el estudio.
Entonces, podemos hacer el análisis de dos grupos concretos de muestras indicando solo estas en el fichero de grupos (subconjunto del total), o en caso de analizar todas las muestras del estudio, el fichero presentará todas las muestras con los grupos correspondients.

Así el fichero presentará: nombre de la muestra y grupo al que pertenece. A continuación puede ver un pequeño ejemplo.

sample		class
s1		1
s2		1
s3		2
s4		2
s5		3
s6		3

Donde el grupo 1 corresponde al grupo control, el 2 al grupo tratado con el fármaco A i el 3 al grupo tractado con el fármaco B.
El siguiente fichero presenta todas las muestras con los correspondientes grupos de datos de expresión presentados en el primer punto, fichero ejemplo clases.

anterior | siguiente