PLATAFORMA BIOINFORMÀTICA

Real-time RT-PCR

2.Crear un fitxer amb les mostres i la classe a la que pertany cada mostra

L'eina qPCR:Ct permet analitzar el subconjunt de mostra que desitjis d'entre el total de mostres presents en l'estudi.
Per tant, podem fer l'anàlisi de dos grups concrets de mostres indicant només aquestes en el fitxer de grups (subconjunt del total), o en cas d'analitzar totes les mostres de l'estudi, el fitxer presentarà totes les mostres amb els grups corresponents.

Així el fitxer constarà de: nom de la mostra i grup al que pertany. A continuació pots veure'n un petit exemple.

sample		class
s1		1
s2		1
s3		2
s4		2
s5		3
s6		3

On el grup 1 correspon al grup control, el 2 al grup tractat amb el fàrmac A i el 3 al grup tractat amb el fràmac B.
El següent fitxer presenta totes les mostres amb els corresponents grups de les dades d'expressió presentades en el primer apartat, fitxer exemple classes.

previ | següent